Die Station der BLS wurde am 1. Juni 1908 von der Ramsei-Sumiswald-Huttwil-Bahn (RSHB) eröffnet. Durch die Lage des Dorfzentrums war eine Anbindung der Gemeinde an die Strecke Ramsei–Sumiswald-Huttwil nur ausserhalb möglich. Von 2004 bis 2009 war Affoltern-Weier Endstation der Züge der Linie S4 der S-Bahn Bern aus Richtung Burgdorf. Seither w...