Durch sie wird gesteuert, auf welchem Hauptbuchkonto (Bestandskonto) der Buchhaltung das aktuelle Finanzgeschäft gebucht wird. Die Kontierungsreferenz kann manuell oder automatisch in Abhängigkeit von Merkmalen zugewiesen werden. Durch die Verwendung verschiedener Kontierungsreferenzen wird eine differenzierte Bestandsgliederung erreicht.